John ist das jüngste Geschwisterkind von Chris Farley. Er wuchs in Madison, Wisconsin, auf, der Sohn von Mary Anne (Crosby) und Thomas John Farley, die Scotch Oil Co. besaßen. Sein älterer Bruder, Kevin P. Farley, ist ebenfalls Schauspieler. Tom, der älteste der Jungen, arbeitet in Madison als Leiter der Chris Farley Foundation. Seine Schwester, Barb, ist eine Vorschullehrerin in Madison. John besuchte die Portsmouth Abbey School in Portsmouth, Rhode Island, und die Regis University in Denver, Colorado, wo er sich auf Marketing spezialisierte. Er studierte und arbeitete nach dem College in der Second City in Chicago und zog 1998 nach LA.
